Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHOX2BQ99453 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHOX2BQ99453 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms