Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms