Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms