Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARAP1Q96P48 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARAP1Q96P48 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms