Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RDH12Q96NR8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms