Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms