Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms