Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC17Q96LX7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC17Q96LX7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms