Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf72Q96LT7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms