Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CFAP36Q96G28 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CFAP36Q96G28 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms