Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BICD1Q96G01 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms