Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL53Q96EL3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms