Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms