Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG4CQ96DT6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms