Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD1AQ96CP6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD1AQ96CP6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms