Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms