Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms