Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKL1Q969V6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 520.8 ms