Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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