Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP2A3Q93084 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2A3Q93084 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms