Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRN2Q92932 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2Q92932 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms