Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRAT1Q92837 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms