Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CSRNP3Q8WYN3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms