Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGDCC4Q8TDY8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IGDCC4Q8TDY8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms