Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BEST2Q8NFU1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms