Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC2Q8NBF2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLRC2Q8NBF2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms