Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD53Q8N9V6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms