Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT2Q8N9I0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT2Q8N9I0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms