Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL3Q8N8U3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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