Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF182Q8N6D2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF182Q8N6D2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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