Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF1Q8N6C5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms