Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CHCHD4Q8N4Q1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CHCHD4Q8N4Q1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CHCHD4Q8N4Q1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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