Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms