Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms