Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM1

SEPT12, Septin-12, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT12Q8IYM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEPT12Q8IYM1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SEPT12Q8IYM1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEPT12Q8IYM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms