Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC6Q8IVU3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERC6Q8IVU3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms