Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms