Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNL1Q8IU54 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms