Protein–RNA interactions for Protein: Q86WU2

LDHD, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHDQ86WU2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHDQ86WU2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHDQ86WU2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms