Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASSF3Q86WH2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASSF3Q86WH2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASSF3Q86WH2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASSF3Q86WH2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASSF3Q86WH2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASSF3Q86WH2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RASSF3Q86WH2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms