Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNMB4Q86W47 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms