Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX7Q7RTT5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms