Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BBS12Q6ZW61 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms