Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAXIP1Q6ZW49 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAXIP1Q6ZW49 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms