Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms