Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM136Q6ZRR5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM136Q6ZRR5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms