Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms