Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF2Q6PJF5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms