Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL35Q6PF15 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms