Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP5Q6NZY7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP5Q6NZY7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms